Nació en Praga en el año 5290. Estudió en las Ieshivot de Polonia con los famosos Sabios Rabí Shlomo Luria (Rashal) y Rabí Moshe Iserles (Rama).

Cuando regresó a Praga fundó una Ieshivá que atrajo a muchos discípulos. En aquellos tiempos se intensificaron las acusaciones y persecuciones contra los judíos, lo que obligó a Rabí Mordejai a abandonar el país y emigrar a Italia donde vivió cerca de 10 años y pudo perfeccionarse en la ciencia de la Cabalá, así como en astronomía y matemáticas.

En el año 5332, fue nombrado gran Rabino de Oronda; luego se trasladó a Lublin donde ejerció el puesto de gran Rabino de la Ieshivá de esa población. Fue designado uno de los representantes rabínicos en el comité de las cuatro ciudades (que reunía 2 veces a los grandes rabinos y presidentes de las cuatro comunidades con el fin de discutir y solucionar cuestiones religiosas).

En el año 5352 Rabí Mordejai fue nombrado gran Rabino de Praga. Redactó su obra Lebush dividida en 10 tomos con decisiones de Halajá después de explicar las diferencias de opiniones entre Posekim.

A pesar de que el Lebush fue muy bien acogido en todo el mundo, ya se había generalizado la aceptación definitiva del Shuljan Aruj y las demás obras de Halajá fueron relegadas a segundo plano.

Rabí Mordejai dedicó toda su vida al servicio del público tanto en asuntos puramente religiosos como sociales. Falleció el 3 de Adar 2, del año 5372.